이 책은 기독교 웹툰 사이트 ‘에끌툰’에서 인기리에 연재되었던 작품을 단행본으로 묶은 것이다. 『요한복음 뒷조사』는 마태복음, 마가복음과 함께 ‘복음서 뒷조사’ 세 번째 시리즈로, 요한복음이 쓰인 배경 상황과 요한 공동체의 삶의 정황이 21세기 한국교회를 무대로 해서 새롭게 탄생했다. 『마가복음 뒷조사』와 『창조론 연대기』 등의 전작에서와 같이 작가는 어렵고 딱딱한 신학적 주제를 쉽고 재미있게 그리는 탁월한 재주를 발휘하여 이번 작품에서도 요한복음의 저자, 공동체, 역사 등의 주요 쟁점을 흥미진진하게 표현해내면서 내용과 재미 두 마리의 토끼를 다 잡았다. 
가까스로 취업에 성공한 믿음의 용사 성경이, 교회에서 상처받고 반항하는 영혼 사페레, 성공 지향적인 위선자 목사 김다윗이 요한복음에 관해 나누는 대화는 현재 한국 기독교의 근원적인 문제를 건드린다. 주인공들은 요한복음의 배경과 주제를 탐구해가면서 그 내용이 지금 이곳 우리의 삶과 교회에 어떤 의미를 지니는지 끊임없이 질문하고, “서로 사랑하라”는 요한복음의 메시지를 어떻게 살아내야 할지에 대해 답한다. 습관적으로 교회는 다니지만 신앙을 실천하는 모습에 대해서는 아무런 고민도 하지 않는 많은 그리스도인들, 상처받아 공동체에서 멀어지고 교회를 떠난 사람들, 교회 앞에 놓인 많은 아픔과 고통에 어떻게 대처해야 할지 답을 찾기 원하는 사람들, 그리고 암담하다고만 말하는 교회에서 여전히 희망을 찾기 원하는 사람들에게 이 책의 이야기가 따뜻한 위로와 치유를 제공할 것이다.